Με βάση το Καταστατικό της που ισχύει από το 1920, έτος ίδρυσης της Ομοσπονδίας, οι σκοποί της καθορίζονται ως ακολούθως:
Να συνενώσει με στενούς δεσμούς αλληλεγγύης και συναδελφότητας όλους τους Έλληνες Ναυτεργάτες με στόχο την επιδίωξη και εξασφάλιση των οικονομικών και ηθικών συμφερόντων τους